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憑據《自由時報》報道，由科技部與經濟部等跨部會所主辦的能源國度型研究計畫，總共耗時5年、耗資200多億翻譯然而如許重大的打算，卻傳出論文剽竊醜聞翻譯該計畫的總主持人為前台大校長李嗣涔，陳發林為執行長，科技部委請台大成立國度計畫辦公室，負責調和管理與審核研究計畫進度與績效翻譯而觸及剽竊論文的呂錫民，是陳發林的大學同窗，陳在2008年禮聘呂擔負台大研究員，並出任該計畫的研究助理，負責相幹資料的彙整。不料在2013年，陳發林接獲學生通知，指稱呂錫民將所搜集來的資料、研究功效，東拼西湊後並掛上自己的名字，爾後更將陳發林在內的數論理學者同列作者，投稿國際期刊。

教育部長吳思華接管採訪時被問及相幹問題時暗示，學界一直被詬病太甚正視數目，典範應當重塑，但這不是單一黉舍可做到的事，教育部會協助各校從新自我定位，以集體力量改變典型，翻轉曩昔的陋習。並且指出，這件事對於台灣學術界的名譽有必然水平影響，日後將會與科技部合作，想出改善之方翻譯

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工作爆發後，陳發林也隨即向李嗣涔敷陳，並由律師提告侵犯著作權、姓名權等，後在該年11月和解，要求呂錫民簽下許諾書，不窮究民、刑事責任。而科技部目前已成立學術倫理調查委員會查詢拜訪。